在第三季中，团队继续调查这片牧场土地的秘密，以及其超越常规的其他维度异域接触者，努力揭开斯金沃克牧场的深层秘密。。哥斯拉破坏日本多年，〈G对策总部〉发明黑洞炮对付。但实验出意外，引来古代巨大昆虫超翔龙重现，并攻击哥斯拉。日本成了哥斯拉、超翔龙及人类三方的战场。。
